Gesamttabelle
| Platz | Verein | Spiele | S | U | N | Tore | Diff | Punkte | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |
1. FC KaiserslauternKaiserslautern | 8 | 6 | 1 | 1 | 19:13 | 6 | 19 |
| 2. |  |
1. FSV Mainz 05Mainz | 8 | 5 | 2 | 1 | 20:10 | 10 | 17 |
| 3. |  |
SC FreiburgFreiburg | 8 | 5 | 1 | 2 | 15:7 | 8 | 16 |
| 4. |  |
MSV DuisburgDuisburg | 8 | 4 | 2 | 2 | 15:10 | 5 | 14 |
| 5. |  |
Rot Weiss AhlenAhlen | 8 | 4 | 2 | 2 | 14:14 | 0 | 14 |
| 6. |  |
SpVgg Greuther FürthFürth | 8 | 4 | 1 | 3 | 21:15 | 6 | 13 |
| 7. |  |
Alemannia AachenAachen | 8 | 4 | 1 | 3 | 12:10 | 2 | 13 |
| 8. |  |
Hansa RostockRostock | 8 | 3 | 3 | 2 | 21:11 | 10 | 12 |
| 9. |  |
VfL OsnabrückOsnabrück | 8 | 3 | 2 | 3 | 15:17 | -2 | 11 |
| 10. |  |
TSV 1860 MünchenMünchen | 8 | 3 | 1 | 4 | 12:9 | 3 | 10 |
| 11. |  |
FC St. PauliPauli | 8 | 3 | 1 | 4 | 15:20 | -5 | 10 |
| 12. |  |
FC Ingolstadt 04Ingolstadt | 8 | 3 | 1 | 4 | 13:18 | -5 | 10 |
| 13. |  |
1. FC NürnbergNürnberg | 8 | 2 | 3 | 3 | 10:11 | -1 | 9 |
| 14. |  |
TuS KoblenzKoblenz * | 8 | 3 | 2 | 3 | 13:15 | -2 | 8 |
| 15. |  |
FC AugsburgAugsburg | 8 | 2 | 0 | 6 | 10:15 | -5 | 6 |
| 16. |  |
SV Wehen WiesbadenWiesbaden | 8 | 1 | 3 | 4 | 8:19 | -11 | 6 |
| 17. |  |
Rot-Weiß OberhausenOberhausen | 8 | 2 | 0 | 6 | 8:21 | -13 | 6 |
| 18. |  |
FSV FrankfurtFrankfurt | 8 | 1 | 2 | 5 | 9:15 | -6 | 5 |
Liga-Tabelle 2008/09
* -3 Punkte; Verstöße gegen Lizenzierungsauflagen