Gesamttabelle
| Platz | Verein | Spiele | S | U | N | Tore | Diff | Punkte | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |
FC Ingolstadt 04Ingolstadt | 1 | 1 | 0 | 0 | 3:2 | 1 | 3 |
| 2. |  |
1. FC NürnbergNürnberg | 1 | 1 | 0 | 0 | 2:1 | 1 | 3 |
| 3. |  |
Rot Weiss AhlenAhlen | 1 | 1 | 0 | 0 | 2:1 | 1 | 3 |
| 4. |  |
SC FreiburgFreiburg | 1 | 1 | 0 | 0 | 2:1 | 1 | 3 |
| 5. |  |
Alemannia AachenAachen | 1 | 1 | 0 | 0 | 2:1 | 1 | 3 |
| 6. |  |
1. FC KaiserslauternKaiserslautern | 1 | 0 | 1 | 0 | 3:3 | 0 | 1 |
| 7. |  |
1. FSV Mainz 05Mainz | 1 | 0 | 1 | 0 | 3:3 | 0 | 1 |
| 8. |  |
VfL OsnabrückOsnabrück | 1 | 0 | 1 | 0 | 2:2 | 0 | 1 |
| 9. |  |
FC St. PauliPauli | 1 | 0 | 1 | 0 | 2:2 | 0 | 1 |
| 10. |  |
MSV DuisburgDuisburg | 1 | 0 | 1 | 0 | 2:2 | 0 | 1 |
| 11. |  |
Hansa RostockRostock | 1 | 0 | 1 | 0 | 2:2 | 0 | 1 |
| 12. |  |
TuS KoblenzKoblenz * | 1 | 1 | 0 | 0 | 3:0 | 3 | 0 |
| 13. |  |
SpVgg Greuther FürthFürth | 1 | 0 | 0 | 1 | 2:3 | -1 | 0 |
| 14. |  |
SV Wehen WiesbadenWiesbaden | 1 | 0 | 0 | 1 | 1:2 | -1 | 0 |
| 15. |  |
TSV 1860 MünchenMünchen | 1 | 0 | 0 | 1 | 1:2 | -1 | 0 |
| 16. |  |
FC AugsburgAugsburg | 1 | 0 | 0 | 1 | 1:2 | -1 | 0 |
| 17. |  |
FSV FrankfurtFrankfurt | 1 | 0 | 0 | 1 | 1:2 | -1 | 0 |
| 18. |  |
Rot-Weiß OberhausenOberhausen | 1 | 0 | 0 | 1 | 0:3 | -3 | 0 |
Liga-Tabelle 2008/09
* -3 Punkte; Verstöße gegen Lizenzierungsauflagen