Gesamttabelle
| Platz | Verein | Spiele | S | U | N | Tore | Diff | Punkte | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |
1. FC KaiserslauternKaiserslautern | 10 | 7 | 1 | 2 | 22:15 | 7 | 22 |
| 2. |  |
1. FSV Mainz 05Mainz | 10 | 6 | 3 | 1 | 21:10 | 11 | 21 |
| 3. |  |
SC FreiburgFreiburg | 10 | 6 | 1 | 3 | 18:8 | 10 | 19 |
| 4. |  |
SpVgg Greuther FürthFürth | 10 | 5 | 2 | 3 | 24:17 | 7 | 17 |
| 5. |  |
Rot Weiss AhlenAhlen | 10 | 5 | 2 | 3 | 16:17 | -1 | 17 |
| 6. |  |
TSV 1860 MünchenMünchen | 10 | 5 | 1 | 4 | 15:9 | 6 | 16 |
| 7. |  |
FC St. PauliPauli | 10 | 5 | 1 | 4 | 19:21 | -2 | 16 |
| 8. |  |
MSV DuisburgDuisburg | 10 | 4 | 3 | 3 | 16:12 | 4 | 15 |
| 9. |  |
Alemannia AachenAachen | 10 | 4 | 2 | 4 | 13:13 | 0 | 14 |
| 10. |  |
Hansa RostockRostock | 10 | 3 | 4 | 3 | 22:13 | 9 | 13 |
| 11. |  |
1. FC NürnbergNürnberg | 10 | 3 | 4 | 3 | 13:13 | 0 | 13 |
| 12. |  |
VfL OsnabrückOsnabrück | 10 | 3 | 2 | 5 | 15:21 | -6 | 11 |
| 13. |  |
FC Ingolstadt 04Ingolstadt | 10 | 3 | 2 | 5 | 14:20 | -6 | 11 |
| 14. |  |
FC AugsburgAugsburg | 10 | 3 | 1 | 6 | 14:18 | -4 | 10 |
| 15. |  |
TuS KoblenzKoblenz * | 10 | 3 | 3 | 4 | 14:17 | -3 | 9 |
| 16. |  |
Rot-Weiß OberhausenOberhausen | 10 | 3 | 0 | 7 | 11:24 | -13 | 9 |
| 17. |  |
FSV FrankfurtFrankfurt | 10 | 1 | 4 | 5 | 11:17 | -6 | 7 |
| 18. |  |
SV Wehen WiesbadenWiesbaden | 10 | 1 | 4 | 5 | 8:21 | -13 | 7 |
Liga-Tabelle 2008/09
* -3 Punkte; Verstöße gegen Lizenzierungsauflagen